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GeoMx®

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테라젠바이오는 2021년 유전체 업계 최초로 단일세포분석(Single Cell Analysis) 시조직 위치 정보를 파악할 수 있는 GeoMx® Digital Spatial Profiler를 도입하고제조사로부터 '서비스 제공자 인증(CSP)'를 획득한 바 있습니다. 단일세포분석을 통해조직 내 개별 세포의 정보를 유지한 상태에서 유전체 데이터를 확보할 수 있으며, 특정위치에서 발현되는 유전체 및 세포의 특성과 세포간의 상호작용을 이해하는 것에도움을 줄 수 있습니다. 뿐만 아니라 동결조직 뿐 아니라 FFPE(포르말린 고정 파라핀조직 단편) 에서 추출한 RNA 검체도 정확하게 분석이 가능해 미세환경 내 면역세포,섬유아세포, 세포의 기질 등을 3차원 공간으로 분석이 가능합니다.

샘플&실험정보

샘플&실험정보
Sequencing Platform GeoMx® Digital Spatial Profiler
TAT 4-5주
Sample Requirement FFPE 5 slide 5um, L 36.2mm, W 14.6mm (2주 이내 section, FFPE block 은 최대 10년까지)
Library Kit GeoMx® Whole Transcriptome Atlas RNA (WTA) / GeoMx® Cancer Transcriptome Atlas RNA (CTA) 이외는 사전 조율 필요
Recommended Sequencing Depth 샘플마다 상이, 사전 협의 후 진행

주요 분석서비스

주요 분석서비스
Standard Analysis Advanced Analysis
Spatial Sequencing Expression data set
Differential expression genes (DEGs)
Statistical test
Survival curve
GO analysis
Pathway
Gene set enrichment analysis (GSEA)
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